Opracowana metoda pozwala na określenie stopnia degradacji rzek, przede wszystkim w odniesieniu do ich trofizmu. Jest to czynnik, który obecnie stanowi najważniejsze zagrożenie naszych wód powierzchniowych i jednocześnie rośliny wodne najsilniej na niego reagują. Wieloletnie badania wykazały, że metoda daje precyzyjny, powtarzalny wynik. Przeprowadzona ocena błędu związanego z metodą, czynnikami terenowymi i personelem wykonującym badania pozwala na zastosowanie jej w monitoringu.
Makrofitowa Metoda Oceny Rzek odnosi się w pełni do wszystkich typów rzek w Polsce, zarówno nizinnych, jak też wyżynnych i górskich. Można stosować do wszystkich grup wielkościowych, zarówno strumieni i potoków, jak i bardzo dużych rzek, Metoda może być wykorzystywana w ocenie silnie zmienionych cieków i kanałów oraz przyujściowych odcinków będących pod częściowym wpływem wód morskich. Należy przy tym podkreślić, że zasady klasyfikacji w oparciu o Makrofitowy Indeks Rzeczny są identyczne dla wszystkich typów rzek występujących w Polsce a ich klasyfikacja różni się jedynie wartościami granicznymi poszczególnych klas jakości ekologicznej.
Wartości graniczne wskaźnika MIR dla 39 typów makrofitowych i pięciu klas stanu ekologicznego.
Makrofity 
